Anthropic

Claude обнаружил похожую на CRISPR ферментную систему, функция которой до сих пор неизвестна

В компании Anthropic заявили, что модель Claude обнаружила ранее неописанную ферментативную систему в ДНК бактериофагов — вирусов, которые заражают бактерии. Рядом с геном фермента располагается длинная последовательность повторяющейся ДНК, напоминающая CRISPR-массив. В компании пока не знают, какова функция этой системы.

Claude обнаружил похожую на CRISPR ферментную систему, функция которой до сих пор неизвестна

Anthropic объявила об этом результате в среду в записи в блоге и препринте, который еще не прошел рецензирование. Это первый результат работы новой группы молекулярной биологии и лаборатории внутри компании. Команда называет эту систему обратными транскриптазами, ассоциированными с массивами (array-associated reverse transcriptases, или ART).

Что обнаружил Claude

Обратная транскриптаза — это фермент, который копирует РНК в ДНК. Бактерии часто используют такие ферменты для защиты от вирусов. Система ART состоит из трех частей: самого фермента, соседнего партнерского гена и массива равномерно распределенных повторяющихся участков ДНК.

Эта структура напоминает CRISPR, где массив содержит банк различных РНК-гидов. Согласно препринту, массивы ART содержат от 3 до 21 копии короткого повтора. Ни один из них не имеет генов cas, которые системы CRISPR переносят поблизости.

В ходе лабораторных тестов ученые Anthropic выяснили, что этот массив считывается как набор отдельных коротких РНК. Согласно опубликованным данным для фага Staphylococcus, через 15 минут после заражения эти РНК составляли до 8% всей РНК фага. В препринте отмечается, что команда еще не доказала активность фермента или его способность работать с этими РНК.

В Anthropic утверждают, что лишь горстка известных систем разделяет этот набор характеристик. Все они способны вырезать, копировать или вставлять ДНК.

Как проводился поиск

Команда поставила перед Claude одну исследовательскую задачу: найти новые системы обратной транскриптазы в базе данных, содержащей 1,9 миллиарда белковых кластеров. Остальное сделали агенты на базе Claude Mythos 5. Один агент планировал и выполнял каждую задачу, в то время как второй проверял ее, а по ходу дела агенты открывали новые задачи.

Кампания длилась 21,5 час без вмешательства человека, охватив 949 сеансов агентов и 215,6 миллиона токенов, говорится в препринте. Агенты обнаружили около 200 000 кластеров ферментов, оценили 3 564 семьи-кандидата партнерских белков и передали 19 отчетов на рассмотрение человеку.

Система ART была найдена в ходе побочного исследования. Агент, читавший последовательность ДНК рядом с необычным ферментом, написал, что видит паттерн повторов «невооруженным глазом». Затем он подсчитал повторы, сравнил их с известными системами и изучил литературу перед составлением отчета.

Фэн Чжан (Feng Zhang), пионер технологии CRISPR из Массачусетского технологического института (MIT) и Института Броуда, проверил препринт. Anthropic опубликовала его комментарий вместе со своей статьей.

«Идентификация РНК-повторяющихся массивов, ассоциированных с обратными транскриптазами, представляет собой действительно интригующее явление и заслуживает дальнейшего изучения», — заявил Чжан.

Что пока неизвестно

Сам фермент не был новым. По словам специалистов Anthropic, более ранние исследования уже идентифицировали его, однако Claude, судя по всему, первым заметил этот массив и партнерский белок. В препринте отмечается, что в первом отчете о геноме одного из ART-фагов описывался фермент, но не повторы или партнерский ген.

Эту находку также оказалось сложно воспроизвести. Anthropic провела ту же кампанию еще десять раз. Ни один из повторных запусков не прочитал ДНК выше фермента по ходу транскрипции, и все десять пропустили массив. Авторы объясняют это масштабом поиска и непредсказуемым поведением агентов.

В ходе фиксированных тестов четыре наиболее способные модели Anthropic описывали массив не менее чем в 90% случаев, когда им напрямую предоставляли ДНК. При использовании файлов и инструментов этот показатель падал до 32%. Часто модель просто не считывала достаточное количество ДНК, чтобы обнаружить полный повтор.

Команда также заглянула внутрь Mythos 5 во время чтения последовательности. Два внутренних сигнала активировались на повторах прямо перед тем, как агент назвал их. Ранее Anthropic уже создавала инструменты для изучения невысказанных мыслей Claude.

Стоящая за этим лаборатория

Anthropic сформировала эту группу весной 2026 года. В компании заявляют, что ее лаборатория в районе Залива Сан-Франциско работает исключительно на уровнях биобезопасности 1 и 2 и не работает с патогенами, поражающими человека. Всю лабораторную работу выполняют ученые-люди. Команда использует Claude Code и Claude Science, которые Anthropic запустила в июне.

Группа входит в состав подразделения наук о жизни Anthropic, которое также занимается поиском лекарств. В апреле Anthropic заплатила 400 миллионов долларов за стартап Coefficient Bio. В том же месяце OpenAI представила GPT-Rosalind — модель для исследований в области наук о жизни.

В Anthropic сообщили, что в настоящее время проводятся новые эксперименты, чтобы выяснить функции ART. Компания призывает других ученых присылать свои исследовательские предложения.

Опубликовано 23 сентября 2026 - 12:27 Наверх